여름휴가에 오오사카로 코난과 친구들을 초대하려고 서쪽의 명탐정 하쯔토리 헤이지가 찾아왔다.
그러나 코시엔에 갈 것인지, 타카라즈카에 갈 것인지로 카즈하와 대판 싸움을….
결국, 코고로가 의뢰를 받은 살인사건의 다잉 메시지를 푸는 추리승부로 결정하게 되는데…?
★지난 줄거리★
꼬마 명탐정 에도가와 코난. 실은 검은 조직의 독약을 먹고 작아진 고교생 명탐정 쿠도 신이치. 유령선 가장파티 살인사건을 해결한 쿠도 신이치는 하쯔토리 헤이지 였다. 그리고 죠디 선생님에게 끌려갔던 하이바라는 코난이 변장했던 모습. 검은 조직의 낌새를 눈치챈 코난의 작전으로 아라이데 선생님으로 변장했던 베르쿠트와 FBI였던 죠디, 코난이 대결. 하지만 오해가 생겨, 거의 다 잡은 검은 조직을 놓쳐버리고 만다.
비가 내리는 하교길, 소년탐정단은 사건을 만나게 된다. 도주 중인 살인마와 부딪친 아유미의 손에 범인의 소지품에서 찍힌 거라고 생각되어지는 "5"와 닮은 마크가…. 그리고, 겐타 엉덩이에도 같은 마크의 흔적이…?!