특별임무를 수행하는 정부기관 KSA의 안상인과 나연수. 기관 내에서 일할 미래의 인재를 선발하기 위한 임무를 맡아, 후보생으로 지목된 신우와 익한이 있는 예란고등학교에 찾아오게 된다. 한편, 유니온의 12장로 친위대이자 최강 무력단체 켈베로스와 유리는 한국에 있었던 일련의 사건들 때문에 입국하게 되고, 조사를 위한 것이라며 KSA를 제멋대로 뒤흔들게 되는데…. 신우와 익한을 대상으로 한 무리한 후보생 검증과정에서 RK-4(타오, 타키오, M-21, 레지스)와 KSA(안상인, 나연수)는 대립각을 세우게 되지만, 서로가 어떤 존재인지 자칫 유니온에 알려지게 된다면 걷잡을 수 없는 상황에 직면할 것이라는 생각에 할 수 없이 어딘가 불편한 동맹을 맺게 된다. 하지만 너무나 일찍 켈베로스에게 들키게 된 그들은 엄청난 힘의 차이를 보이는 켈베로스와 힘겨운 싸움을 시작하게 되는데…. 과연 그들은 어떻게 이 고비를 벗어 날 것인가?
