대학에서 국문학과를 전공했다. 형 박기정도 만화가이다. 어린 시절부터 만화를 좋아해 형과 함께 여러 만화를 두루 설렵했으며, 좋아하는 만화를 참고해 독학으로 만화를 공부했다. 학창 시절부터 뛰어난 실력을 발휘했으며, 부업으로 만화를 그려 생활비를 벌기도 했다. 이러한 경험이 계기가 돼 본격적으로 만화가의 길을 걷기 시작했다.
1958년 단행본「두통이」이를 내놓으면서 본격적으로 정식로 데뷔했다. 같은 해『만화세계』에「두통이」를 연재 했다. 1960년 크로바문고 발행인을 역임하며 작가로서 뿐아니라 발행인으로서 폭넓게 활동했으며, 작가로서도 왕성한 창작열을 불태우며 1963년 크로바문고를 통해 50권 분량의 장편만화「올림픽소년」을 출간했다. 1964년 월간『여학생』의 발행인을 맡았고, 1965년《소년한국일보》를 통해「푸른하늘 저멀리」를, 월간『여학생』에「노미호와 주리혜」를 연재 했다. 당시 상당한 인기를 얻었던 작품으로, 연재 중간에 자신의 문하생으로 활동하고 있었던 만화가 이상무에게 연재를 인계해 줬다. 당시 무명이었던 이상무는 이 작품을 통해 스타작가로 발돋움할 수 있었다.
1970년대에 들어「두통이 훈련병」,「왈가닥 대소동」등을 발표했다. 대표작「두통이」시리즈는 남녀노소 모두에게 건강한 웃음을 선사해 준 전형적인 명랑만화로, 건강한 어린이 상을 제시하여성 독자들 사잉에서 많은 사랑을 받았다. 만화 창작이론 연구에 많은 노력을 기울여「만화작법」,「만화가가 되려면」,「만화스토리 작법」등 만화 작법서를 여러 권 집필했으며, 1985년 제일만화학원을 설립해 수많은 만화가를 키워냈다. 문하생으로 이상무, 고행석, 배금택, 지성훈, 윤필, 김희섭, 오흥선 등이 있으며, 한국만화가협회 7, 9대 회장, 국제만화가연맹 한국지부장, 청강만화역사박물관 관장 등을 역임했다.


* 경력 사항
1960 크로바문고 발행인 역임
1964 여학생 발행인
1985 제일만화학원 설립
한국만화가협회 7, 9대 회장
국제만화가연맹 한국지부장
청강만화역사박물관 관장 역임
부천만화정보센터 이사

* 작품 활동
1958「두통이」를『만화세계』에 연재하며 데뷔
1963「올림픽소년」출간
1964「삼형제」출간
1965「푸른하늘 저멀리」를《소년한국일보》에 연재,「노미호와 주리혜」를『여학생』에 연재
1968「아기별」
1969「아차검객」
1971「광산과 소년」
1972「전투병 주임상사」,「태극 유니포옴의 자랑」,「숙이 누나」,「조국에 고했다」,「성난 불길」
1974「날으는 옷」,「날으는 소년」,「날으는 V호」,「날으는 V호의 활약」
1975「漫畵作法(만화작법)」,「사병 두통이」
1976「장교 두통이」,「장성 두통이」,「원수 두통이」
1977「용감한 삼형제」출간
1980「두통이 만세」,「왈가닥 대소동」출간
1987「펜화기법」,「만화기법강좌」출간
1988「만화영화기법」출간
1991「만화스토리작법」출간
1992「만화영화기법」2권 출간
1998「스토리」편역
1998「표현기법」편역
1998「연출기법」편역
1997「캐릭터」편역
1999「순정만화」편역
1999「실용 펜화」출간
2000「기획과 연출」편역
2008「박기준의 세계 속 한국만화 야사」출간 (만화규장각클래식03)
2009「박기준의 한국만화야사」출간 (만화규장각지식총서07)